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El IUICP cuenta con diversos grupos de investigación en distintas áreas de las ciencias forenses: Acústica Forense, Antropología Forense, Derecho Penal y Procesal, Entomología Forense, Genética Forense, Lingüística Forense, Lofoscopia, Palinología Forense, Iinformática y Electrónica Forense y Química Forense (INQUIFOR). Estos grupos son mixtos, al estar formados por profesores universitarios, tanto del ámbito jurídico como científico (UAH, UAM, UCLM, UAX, etc), profesionales de la criminalística (CGPC, SECRIM, INTCF) y miembros de la Fiscalía General del Estado.
Los proyectos de investigación actualmente en curso son: